年龄、分娩方式、饮食、抗生素使用和疾病等都会影响益生菌在内的肠道菌群组成，想要益生菌更好的保护身体健康，需要建立良好的生活方式，从而更好地保护身体健康。
尽量顺产，争取母乳喂养
研究报导，自然生产的婴儿与剖腹产的婴儿肠道菌群存在很大差异，自然生产更利于婴儿初期乳酸菌接种及繁殖。而母乳喂养的婴儿比食用奶粉的婴儿肠道内双歧杆菌更占优势，因此建议准妈妈们顺产，争取母乳喂养。
饮用益生菌菌粉及其他乳酸饮料可以增加肠道内益生菌，而一些产品上标注的“双歧因子”、“益生元”等也是通过促进肠道内双歧杆菌等益生菌的生长来发挥作用的。
减少对幼儿使用抗生素
人们服用抗生素治疗和预防疾病的时候，会扰乱肠道菌群的生态平衡，肠道内的重要厌氧菌，如双歧杆菌、乳酸杆菌、拟杆菌都会大量减少，而一些病原菌如肠球菌则呈现增加的趋势。
益生菌对人体的健康十分重要，服用益生菌能增加有益菌的数量，抑制有害菌的产生。健康的个体必须是有益菌与有害菌相互的拮抗均衡，利用体内自身益生菌的作用抑制有害菌，而非摄入杀菌药物，采取“一锅端”的方式消灭有害菌的同时也抑制了有益菌。
因此，建议及时给宝宝补充益生菌，能增强宝宝的抗病能力和身体抵抗力。宝宝感冒不急于使用抗生素，可通过食疗缓解。如果给宝宝使用了抗生素，可以给宝宝补充益生菌，有助有益菌类的重新繁殖。
抵抗力较差的幼儿和老年人，以及病人都可以食用益生菌，益生菌可以维持体内自身菌群平衡，保持身体健康，预防或治疗某些疾病。
