便秘的原因很多，医学上把便秘分为与一般生活行为有关的慢性习性变成习惯的'习惯性便秘"和某种疾病引起的'器质性便秘"两种。
但是大部分人的便秘属於习惯性便秘，造成习惯性便秘的可能原因包括：
1.水分摄取不足：足够的水分可使粪便柔软有弹性，减低粪便的硬度以利排便。
2.纤维摄取不足：外食族的饮食内容容易缺乏纤维质，使肠胃蠕动缓慢造成便秘。足够的纤维可使粪便成条状，减少肠内压，增加大肠蠕动。
3.油脂摄取不足：适量的脂肪可使粪便表面光滑，以利粪便在肠道的输送及排出。如长期错误减重不吃油，也容易造成便秘。
4.排便习惯不良：没有养成定时排便的习惯，想到要排便才去上厕所，或是经常憋便的人，久而久之也会便秘。
5.排便动力缺乏：老年人、缺乏运动者或是长期卧床的人，腹肌衰弱、肠子蠕动不足，无法用力排便，容易便秘。
6.情绪因素：容易紧张、工作压力或思虑过度的人，将影响传导排便的神经，并且减缓胃肠蠕动功能，造成便秘。
7.药物作用：服用许多药物如止痛药、抗忧鬱药物、镇定剂、降血压药物、利尿剂、钙片、含铝之胃乳片、铁剂、抗组织胺等，都会造成排便不顺的副作用。
